管理科學與工程學科還設有“上海市能源經濟與管理智庫基地”和“運營與供應鏈管理研究中心”及“大數據與商務智能研究所”兩個校級研究機構。近年來,獲批國家自然科學基金重點項目1項,國家“十二五”科技支撐計劃課題1項,國家“十一五”科技支撐計劃專題項目1項,國家自然科學基金50余項。本學科成員近年在國內外公開學術期刊上發表論文200余篇,代表性成果以第一或通訊作者發表于Management Science、Operations Research、Production and Operations Management、Manufacturing & Service Operations Management、Journal of Management Information System和《管理科學學報》等國內外管理學頂級期刊,獲得教育部人文社科優秀成果二等獎、上海市科技進步獎二等獎、上海市哲學社會科學優秀成果獎著作二等獎等多個獎項。